目前我国食品安全面临的挑战和存在的问题主要有：食品制造过程中使用劣质原料，添加有毒物质的情况仍然难以杜绝；超量使用食品添加剂，滥用非食品加工用化学添加剂，加工食品过程中使用劣质原料；农产品、禽类产品的安全状况也不容乐观；抗生素、激素和其他有害物质残留于禽、畜、水产品体内；面临转基因食品的潜在威胁，尽管目前还没有足够证据证明转基因食品对人类有害，但转基因食品安全性问题已引起人们的密切关注。
　　既然全社会和政府对食品安全问题如此重视，为什么食品安全问题还是层出不穷呢？主要原因在于对监管者的问责不到位。问责制是一种监督与责任追究相结合的制度，它包括了问责标准的确立、问责程序及问责方法的构建、问责制度的完善等一系列内容。食品安全监督领域的行政问责，不应该仅仅局限于对食品质量问题的一种责任追究机制或一种纯粹的惩戒措施，而应该与国家相关政策、法律法规等有机衔接，成为一项互为补充的独立制度。通过问责制度形成对各级监管者的问责压力，防止寻租行为，激励他们对所管辖的食品安全工作给予高度的重视，从而加强对事故的处理和预防，以实现政府的管治目标。如果相关的食品企业出现了食品安全问题，那么相应的监管部门的负责人，甚至企业所在地区的政府负责人就应该无条件地接受问责，问责应该得到严格的执行。
　　因此，有效解决食品安全问题的关键是强化对监管者的问责。在中国目前的治理结构中，行政权占据主导地位，这既是我们的优势，也是一些问题的根源所在。要想限度地利用这一优势，又尽可能地避免由此而引发的各种治理问题，就必须要严格执行对监管者的问责，这是整个食品监管体系的牛鼻子，只有抓住这个牛鼻子，才能从根本上解决食品安全的监管问题。
　　强化对违法者的惩戒力度。法律制订得再多再细，如果不严格执行也是不行的。要想从根本上遏制造假行为，就必须同时加大执法力度和处罚力度，让造假的成本远大于造假的收益，进而使造假者望而却步。
　　发挥媒体的监督作用。要从根本上解决食品安全问题，就必须引入独立的第三方监督，这个第三方从本质上说应该是广大消费者，但由于消费者过于分散，所以独立的媒体监督往往就成为消费者的*佳代理人。尤其是网络媒体，具有成本低、传播速度快、舆论压力大等特点，实际上近年来多起食品安全事件的舆论监督主力都是网络媒体。